Genetické parametry Heritabilita, korelace. primární GP genetický rozptyl prostřeďový rozptyl kovariance sekundární GP heritabilita opakovatelnost genetické.

Prezentace na téma: "Genetické parametry Heritabilita, korelace. primární GP genetický rozptyl prostřeďový rozptyl kovariance sekundární GP heritabilita opakovatelnost genetické."— Transkript prezentace:

1 Genetické parametry Heritabilita, korelace

2 primární GP genetický rozptyl prostřeďový rozptyl kovariance sekundární GP heritabilita opakovatelnost genetické a prostřeďové korelace

3 Heritabilita = dědivost do jaké míry je znak podmíněný geneticky? do jaké míry je předáván z rodičů na potomky? číselně vyjadřujeme koeficientem heritability h 2 ; nabývá hodnot od 0 do 1;

4 platí pro danou populaci daný čas konkrétní podmínky ! nemá obecnou platnost !

5 hodnota dědivosti závisí na metodě výpočtu struktuře populace podmínkách chovu úrovni užitkovosti úrovni plemenářské práce sezónnosti vlastnosti pohlavním dimorfismu četnosti souboru přesnosti výpočtu meziplemenných rozdílech (užitkovém zaměření)

6 metody podobnost rodičů a potomků rozklad proměnlivosti neparametrické metody selekční experimenty

7 1. podobnost rodičů a potomků regrese potomka na rodiče: h 2 = 2.b xy regrese potomka na průměr rodičů: h 2 = b xy regrese průměru potomků na průměr rodičů: h 2 = b xy korelace mezi sourozenci: h 2 = 2.r xy korelace mezi polosourozenci: h 2 = 4.r xy

8 2. rozklad proměnlivosti z analýzy variance teoreticky vychází z předpokladu podobnosti příbuzných je-li znak dědivý, jsou si příbuzní podobnější náhodní jedinci v populaci

9 žádnástředníúplná 123123123 111221123 222313123 333123123 žádnástřednívysoká střednížádná nízká dědivost mezi uvnitř střední dědivost vysoká dědivost podobnost otec: potomci

10 Analýza variance - jednofaktorová proměnlivostSSdfMS meziSS A df A = p – 1MS A =SS A / df A uvnitřSS E df E = n – pMS E = SS E / df E celkemSS C df C = n – 1-

11 složky MS MS E : proměnlivost uvnitř skupiny je podmíněna působením prostředí: MS E : = V E MS A : proměnlivost mezi skupinami je podmíněna geneticky a vlivy prostředí, ve kterém zvířata produkují: MS A = V E + n 0 V G vážený počet jedinců ve skupině

12 intraklasní korelační koeficient hodnota závisí na tom, jaká je příbuznost (genetická podobnost) porovnávaných jedinců: pokud porovnáváme polosourozence, je jejich genetická podobnost = 0,25 (proto je výsledek roven ¼ h 2 )

13 3. neparametrické metody obtížně měřitelné znaky neznáme fenotyp, známe pořadí korelační koeficient dle Spearmana stanovíme pořadí rodičů a nezávisle pořadí potomků; diference mezi pořadím d i n - počet dvojic

14 4. selekční experiment realizovaná dědivost realizovaná dědivost v genetickém zisku

15 Fenotypové, genetické, genotypové a paratypové korelace vztahy mezi vlastnostmi pozitivní – zvýšením jednoho znaku se zvyšuje i druhý negativní – zvýšením jednoho znaku se snižuje druhý

16 Fenotypová korelace závislost mezi pozorovanými hodnotami P x a P y ; je daná kombinací závislostí genotypových hodnot a účinků prostředí; korelační páry = dvojice měření znaku x a znaku y u téhož jedince; r P r PxPy

17 genotypová a genetická korelace genotypová = závislost mezi genotypovými hodnotami znaků x a y; r G ; r GxGy ; genetická = závislost aditivních hodnot obou znaků – častější; vyjadřuje rozsah, ve kterém dvě měření odrážejí, co je geneticky stejná vlastnost (délka křídel : délka thoraxu = délka těla r = 0,75)

18 paratypová korelace prostřeďová korelace; závislost mezi efekty prostředí; r E ; r ExEy ;

19 GxGx GyGy X hxhx Y ExEx EyEy hyhy exex eyey

20 výpočet korelace zohledňuje variance (rozptyly) obou vlastností a jejich vzájemnou kovarianci: zjednodušeně:

21 vztah na genetické úrovni pleiotropní působení genů = gen ovlivňuje více znaků ve stejném čase vazba genů = geny lokalizovány v jedné vazbové skupině; -čím blíže, tím je vazba silnější; -není stálá – crossing over; -vazba mezi skupinami genů;

22 zavedení genů do populace -dočasné korelace -intenzivní využití vybraných jedinců; -přenos skupin vlastností; -narušení náhodným pářením;

23 metody odhadu metoda korelace křížem analýza variance a kovariance realizovaná genetická korelace na základě výsledku selekce

24 1. korelace křížem známe hodnotu znaku x, y u rodiče a potomka XDXD XMXM YDYD YMYM fenotyp matek fenotyp dcer

25 2. analýza variance a kovariance jednofaktorová dvoufaktorová

26 3. z výsledku selekce z genetického zisku; selekční pokus; selekce v běžných podmínkách;

27 selekční pokus selekční zisk v selektované části populace; selekční zisk v neselektované části populace;

28 selekce v běžných podmínkách provádíme selekci dle jednoho znaku; stanovíme dosažený genetický zisk pro oba znaky; známe-li heritabilitu obou znaků, pak při selekci podle X:

29 korelovaný selekční efekt o kolik se v generaci po selekci na znak X změní znak Y, který nebyl předmětem selekce vlastnosti ve vazbě (skot: mléčné složky)

30 příklady skot r P r A r E produkce mléka : % tuku -0,26 -0,38 -0,18 prod. mléka v 1 : 2 laktaci 0,40 0,75 0,26 prasata přírůstek : hřbetní tuk 0,00 0,13 -0,18 přírůstek : výkrmnost 0,66 0,69 0,64 drůbež hm. těla : hm. vejce 0,33 0,42 0,23 hm. těla : snáška 0,01 -0,17 0,08