Použití molekulárních znaků v systematice

Prezentace na téma: "Použití molekulárních znaků v systematice"— Transkript prezentace:

1 Použití molekulárních znaků v systematice

2 Obsah přednášky Co je to molekulární systematika
Zvláštnosti molekulárních znaků Základní přístupy zpracovávání dat Oblasti využití molekulárně taxonomických metod

3 Co je to molekulární systematika
Soubor laboratorních technik a metodických přístupů k analýze dat určených k: Rekonstruci fylogeneze a tokogeneze Determinace organismů Odhalení genetické identity a příbuznosti jedinců na základě molekulárně biologických dat

4 Molekulárně biologické znaky
Mutace fixované genetickým posunem Mutace fixované evolučním svezením se Mutace fixované molekulárním tahem Mutace fixované přirozeným výběrem

5 Typy mutací Bodové mutace (riziko konvergence?)
Inverse, delece, traslokace (ireverzibilní, většinou unikátní) Obsah genů v genomu (konvergence !)

6 Výhody molekulárních znaků
Neutralita znaků Jednoznačnost popisu Nezávislost znaků Kvantita Vážitelnost Kvantifikovatelnost stupně nejistoty

7 Výhody molekulárních znaků
Molekulární hodiny Rozpoznatelnost konvergence Porovnávatelnost vzdálených taxonů Polarita evolučních změn Informace o dřívější struktuře populace

8 Nevýhody molekulárních znaků
Neposkytují informaci o anagenezi. Heterodontus portusjacksoni

9 Nevýhody molekulárních znaků
Neposkytují informaci o anagenezi. Cena. Někdy destruktivní charakter. Snadno dostupné i pro neodborníky.

10 Dva základní přístupy ke třídění organismů
Na podkladě příbuznosti Na podkladě podobnosti

11 Dva základní typy dat Znaková data (characters)
Distanční data (distances)

12 Znakově orientované metody
Sekvenování biopolymerů Alozymy Restrikční mapy VNTR

13 Výhoda znakově orientovaných metod
Experimentální náročnost N (× N2) Kladistické metody Možnost převodu na distanční data

14 Distanční metody Hybridizace v roztoku Imunologické metody
Fingerprinting (RAPD, RFLP)

15 Výhody distančních metod
Cena a rychlost Multilokusový charakter dat

16 Oblasti využití technik molekulární systematiky
Fylogenetika Epidemiologie Taxonomie Populační biologie a genetika Sociobiologie Foresní medicína

17 Závěry Molekulárně biologické znaky mají poněkud jiný charakter než znaky klasické. Jsou mimořádně vhodné pro studium kladogeneze. Nejsou použitelné pro studium anageneze. Jednotlivé třídy molekulárních znaků se zásadně liší svou použitelností pro různé účely.